中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態(tài)研究所上海昆蟲博物館
現(xiàn)收藏全國各地昆蟲標本100多萬號，保藏著一大批瀕危珍稀昆蟲標本及國際和國內(nèi)的危險性檢疫害蟲標本，系統(tǒng)地介紹了昆蟲的起源、演化、形態(tài)特征、生活習性、昆蟲家族等是我國大型的專業(yè)昆蟲館。
中國科學院水生生物研究所淡水魚類博物館
目前亞洲規(guī)模最大、收集種類最多的淡水魚類博物館，是中國科學院在國內(nèi)具有較好基礎的優(yōu)勢學科之一。通過幾十年的工作，已經(jīng)收藏了大量的水生生物標本以及相應的科學積累。
中國科學院動物研究所國家動物博物館
國家動物博物館位于中國科學院奧運村園區(qū)動物研究所內(nèi)，是國內(nèi)外公認的、亞洲最大、研究水平最高、綜合實力最強的動物系統(tǒng)分類與進化研究中心，還將借鑒現(xiàn)代化博物館的主題展示法，采用自然科學與人文科學等多學科的知識集中體現(xiàn)主題，引入4D動感影院等高科技視聽設施，讓深奧的科學哲理變得更加平易近人。
中國科學院南京地質(zhì)古生物研究所南京古生物博物館
中國科學院和江蘇省共建的南京古生物博物館于2005年12月31日向社會非正式開放，大批南京市民和學生以及學齡前兒童來到博物館，參觀和了解地球和生命進化的故事。新完成的博物館以古生物化石為本，以古無脊椎動物、古植物和微體古生物為主，是目前世界上最大的古生物專業(yè)博物館之一。博物館藏品豐富，展品精美，其中尤以“澄江動物群”和包括“中華龍鳥”在內(nèi)的“熱河生物群”化石標本最為珍貴，堪稱國寶級的化石精品。整個展覽講述一個地球和生命演化歷史的故事，內(nèi)容包括一個“生命的進化” 主題展和十四個專題展。展覽引人入勝，精彩生動，寓教于樂。
中國科學院昆明動物研究所昆明動物博物館
昆明動物博物館是中國科學院國家知識創(chuàng)新工程的重要項目及中國科學院重點支持的兩大博物館之一，博物館通過動物的姿態(tài)標本、骨骼標本、皮張標本、浸泡標本、生態(tài)景觀等，按照動物的進化、生息和分布規(guī)律，集中反映這些動物的特征、習性、分布等，體現(xiàn)物種和生境的多樣性、生物與環(huán)境的統(tǒng)一、人與自然的和諧。
中國科學院西雙版納熱帶植物園熱帶雨林民族文化博物館
博物館位于中國科學院西雙版納熱帶植物園園內(nèi)，面積2000平方米，外觀體現(xiàn)了傣族建筑的風格。館轄熱帶雨林、民族森林文化展廳和熱帶雨林民族文化研究中心等，是一個集公眾教育、科學研究和文物保存等功能的專業(yè)性博物館。